Aminoácidos

Los aminoácidos son los monómeros de las proteínas. Químicamente están formados por un átomo de C central o alfa que es quiral, excepto en la glicina. A este C se le unen un H, un grupo amino -NH2, un grupo carboxilo -COOH y un resto hidrocarbonado -R, que varía según el aminoácido, y es el que le otorga la polaridad o apolaridad al aminoácido. A su vez, los polares se dividen en los que no tienen carga, y los que tienen (positiva o negativa). 

La presencia de grupos básicos (-NH2) y ácidos (-COOH) en la misma molécula hacen que sean anfóteros, es decir, que según el pH del medio van a estar cargados o no: a pH ácido con carga positiva (por el -NH3+); a pH isoeléctrico van a estar neutros (-NH3+ y -COO-), que se anulan las cargas) y a pH alcalinos van a estar con carga negativa (por el -COO-).

Existen 20 aminoácidos que conforman las proteínas en el organismo

Estos aminoácidos se pueden clasificar de la siguiente manera

Alifáticos (no polares)

- Glicina (Gli) G

- Alanina (Ala) A

- Valina (Val) V

- Leucina (Leu) L

- Isoleucina (Ile) I

- Prolina (Pro) P

- Metionina (Met) M

Aromáticos

- Fenilalanina (Fen) F

- Triptófano (Trp) W

- Tirosina (Tir) Y

Polares cargados positivamente

- Lisina (Lis) K

- Histidina (His) H

- Arginina (Arg) R

Polares cargados negativamente

- Ácido aspártico (Asp) D

- Ácido glutámico (Glu) E

Polares sin carga

- Asparagina (Asn) N

- Glutamina (Gln) Q

- Treonina (Tre) T

- Cisteína (Cis) C

- Serina (Ser) S

También podemos clasificarlos en:

• Aminoácidos no esenciales: son aquellos que nuestro cuerpo puede fabricar por sí mismo y son: Arginina, ácido aspártico, cisteína, ácido glutámico, glutamina, glicina, prolina, serina, y tirosina.
• Aminoácidos esenciales: son aquellos que nuestro cuerpo no puede fabricar por sí mismo y, por lo tanto, necesitamos ingerir a partir de la dieta. Son: Histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, treonina, triptófano, valina y alanina. 

pKa de los aminoácidos

Los aminoácidos tienen distintas estructuras de ionización y por tanto distintos pKa

Estructuras de ionización quiere decir distintas estructuras del mismo aminoácido en la cual una de sus partes ha sido ionizada por el pH.

Aminoácido	pKa1 -COO-	pKa2 -NH3+	pKa3 -R
Triptófano (Trp) W	2.5	9.4	-
Glicina (Gli)  G	2.4	9.8	-
Alanina (Ala) A	2.4	9.9	-
Valina (Val)   V	2.3	9.7	-
Leucina (Leu) L	2.3	9.7	-
Isoleucina (Ile) I	2.3	9.8	-
Lisina (Lis)      K	2.2	9.1	10.5
Glutamina (Gln) Q	2.2	9.1	-
Tirosina (Tir) Y	2.2	9.2	10,5
Serina (Ser)   S	2.2	9.2	-
Fenilalanina (Fen) F	2.2	9.3	-
Asparagina (Asn) N	2.1	8.7	-
Treonina (Tre)  T	2.1	9.1	-
Metionina (Met) M	2.1	9.3	-
Glutamato (Glu) E	2.1	9.5	4.1
Aspartato (Asp) D	2.0	9.9	3.9
Prolina (Pro)    P	2.0	10.6	-
Cisteína (Cis)  C	1.9	10.7	8.4
Arginina (Arg) R	1.8	9.0	12.5
Histidina (His) H	1.8	9.3	6.0